Численное моделирование функционирования сети онкомаркеров
Семинар: Информационно-вычислительные технологии в задачах поддержки принятия решений
Начало заседания: 11:00
Дата выступления: 22 Март 2016
Организация: ИВТ СО РАН
Авторы: Софья Сенотрусова
Изучение онкомаркеров, направленное на выявление и прогнозирование исхода заболевания, является бурно развивающейся областью в современных медико-биологических исследованиях и клинической практике. В настоящее время в качестве потенциальных маркеров злокачественных опухолей рассматриваются белок p53, его отрицательный регулятор белок Mdm2, а также связанные с ними микроРНК. Для уточнения прогностических свойств этих маркеров были привлечены средства математического моделирования. В качестве базовой используется многопараметрическая математическая модель функционирования сети p53-Mdm2, включающая в себя жесткую нелинейную систему уравнений с запаздыванием. Показано, что данная модель адекватно описывает наблюдаемое в экспериментах поведение сети в условиях стресса.
Для принятой модели численно реализована вычислительная технология предельного перехода от уравнения с запаздыванием к системе ОДУ, описывающих гипотетические промежуточные стадии передачи сигнала в сети p53–Mdm2. Выполнено численное исследование функционирования сети трех онкомаркеров p53–Mdm2–микроРНК в нормальных условиях и в условиях стресса для класса микроРНК, находящихся в прямой функциональной зависимости от p53. Проанализирована применимость разработанной математической модели для изучения прогностических свойств микроРНК как онкомаркеров.