Численные модели динамики р53-зависимых микроРНК
Семинар: Информационно-вычислительные технологии в задачах поддержки принятия решений
Начало заседания: 11:00
Дата выступления: 21 Ноябрь 2017
Организация: НГУ
Авторы: Сенотрусова Софья Дмитриевна
Изучение биомаркеров, направленное на раннее выявление и прогнозирование исхода заболевания, является бурно развивающейся областью в современных медико-биологических исследованиях и клинической практике. Белок p53, его отрицательный регулятор белок Mdm2 и связанные с ними микроРНК принято считать достаточно надежными маркерами онкологических и нейродегенеративных заболеваний, потому что они играют важную роль в регуляции процесса гибели дефектных клеток, и их уровни достигают критических значений в большей части злокачественных опухолей.
В качестве базовой используется математическая модель функционирования сети p53-Mdm2, включающая в себя жесткую нелинейную систему уравнений с запаздыванием. Для принятой модели численно реализована вычислительная технология предельного перехода от уравнения с запаздыванием к системе ОДУ, описывающих гипотетические промежуточные стадии передачи сигнала в сети p53–Mdm2. Разработаны математические модели динамики сети p53–Mdm2–miRNA, в которой микроРНК состоят в прямой положительной зависимости от p53. Изучены варианты дерегуляции микроРНК, иллюстрирующие степень надежности диагностических свойств микроРНК. Адекватность принятого подхода и результатов моделирования подтверждается сопоставлением с известными лабораторными исследованиями достаточно широкого круга конкретных p53-зависимых микроРНК.