В докладе рассматривается модульный подход к моделированию процесса программируемой смерти клетки (апоптоза). Дается описание комплексной модели апоптоза, построенной на базе известных математических моделей, а также информации, накопленной в базах данных биологических путей (Reactome, TRANSPATH, BioModels). Приводится описание методов оптимизации, упрощения и анализа моделей, реализованных в программном комплексе BioUML, а также используемых в ходе работы.