На семинаре будет рассмотрен алгоритм, предложенный в статье:

Wellington: a novel method for the accurate identification of digital genomic footprints from DNase-seq data (2013) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3834841/;

Будут приведены первые результаты сравнения предсказания сайтов этим методом с данными ChIP-seq из базы данных GTRD;

В вводной части семинара будет дано краткое описание существующих методов распознавания сайтов связывания транскрипционных факторов с использованием данных по гиперчуствительным сайтам к ДНКазе I.