В докладе обсуждается задача разработки методологии, алгоритмической базы и программного инструментария для исследований, связанных с моделированием в области биофизики и биомеханики, в частности, к созданию интегрированной модели нематоды C. elegans. Обсуждается ряд алгоритмов моделирования механики сплошных сред в применении моделирование несжимаемой жидкости (PCISPH - Predictive-Corrective Incompressible Smoothed Particle Hydrodynamics), эластичного тела (MSM - mass spring model), моделирование мышц, алгоритмов обработки взаимодействия с неподвижными и твердыми объектами и обработки взаимодействия объектов с различными физическими свойствами. Так же рассматривается вопрос параллельной реализации всех перечисленных алгоритмов для повышения производительности. Для этих целей нами была выбрана платформа OpenCL (платформа для разработки приложений связанных с параллельными вычислениями). 
Одним из результатов, достигнутых в результате данной работы, стала библиотека Sibernetic, способная стать гибким и полезным инструментом при разработке симуляций, связанных с моделированием биомеханики беспозвоночных.