Одним из ключевых аспектов виртуальной биологии является автоматическая генерация персонализированных математических моделей организмов и их частей,

используя информацию из специализированных биологических баз данных и результатов высокопроизводительных экспериментов, характеризующих геном, транскриптом, протеом и метаболом соответствующих организмов.

 

Наиболее подходящий подход для численного моделирования жизни виртуальных организмов в виртуальном мире - это агентное моделирование.

 

Программный комплекс BioUML обеспечивает необходимую информационную инфраструктуру для виртуальной биологии:

- автоматическая генерация моделей,с использованием информации из специализированных баз данных и результатов высокопроизводительных экспериментов;

- различные методы для численного моделирования динамики моделей;

- оценка параметров модели на основе экспериментальных данных для ее персонализации;

- агентное моделирование.

 

В докладе будет приведен ряд примеров использования программного комплекса BioUML для решения задач виртуальной биологии.