На семинаре будет разобран метод предсказания сайтов связывания транскрипционных факторов (ССТФ) Mocap, объединяющий информацию об открытом хроматине и основанных на этих данных футпринтах ТФ, оценке сродства мотивов к ТФ, содержание CpG / GC, эволюционную консервативность потенциальных сайтов связывания и другие факторы. Авторами данного метода было продемонстрировано улучшение качества предсказания ССТФ благодаря использованию подобного геномного контекста. 

По статье:
Chen X. et al. Mocap: large-scale inference of transcription factor binding sites from chromatin accessibility //Nucleic acids research. – 2017. – Т. 45. – №. 8. – С. 4315-4329.