Математическая модель N-гликозилирования иммуноглобулина G
Семинар: Информационно-вычислительные технологии в медицине и биологии
Начало заседания: 16:00
Дата выступления: 12 Сентябрь 2019
Организация: ИВТ СО РАН (Новосибирск)
Авторы: Кутумова Елена Олеговна, Евшин Иван Сергеевич
В докладе будет изложена оригинальная математическая модель N-гликозилирования иммуноглобулина G. Модель была разработана при использовании экспериментальных данных (M. Pucić и др., 2011), представляющих относительные концентрации олигосахаридов, участвующих в указанном процессе, для 1723 человек из двух европейских популяций. Также будут представлены результаты анализа полногеномных ассоциаций между идентифицируемыми (персональными) параметрами модели и данными генотипирования для этих популяций (G. Lauc и др., 2013).
1. Pucić M., Knezević A., Vidic J., Adamczyk B., Novokmet M., Polasek O., Gornik O., Supraha-Goreta S., Wormald M.R., Redzić I., Campbell H., Wright A., Hastie N.D., Wilson J.F., Rudan I., Wuhrer M., Rudd P.M., Josić D., Lauc G. High throughput isolation and glycosylation analysis of IgG-variability and heritability of the IgG glycome in three isolated human populations. Molecular and cellular proteomics. 2011. V. 10. № 10. M111.010090.
2. Lauc G., Huffman J.E., Pučić M., Zgaga L., Adamczyk B., Mužinić A., Novokmet M., Polašek O., Gornik O., Krištić J., et al. Loci associated with N-glycosylation of human immunoglobulin G show pleiotropy with autoimmune diseases and haematological cancers. PLoS Genetics. 2013. V. 9. № 1. e1003225.