Программный комплекс BioUML и его использование для моделирования биологических систем и анализа генетических данных
(по материалам докторской диссертации)
Семинар: Информационные технологии
Начало заседания: 14:35
Дата выступления: 28 Декабрь 2021
Организация: ФИЦ информационных и вычислительных технологий (Новосибирск)
Авторы: Колпаков Федор Анатольевич
Цель данной работы – разработка методологии и инструментария (программный комплекс и базы данных) для эффективного создания и использования сложных модульных моделей биологических систем и анализа генетических данных.
Для достижения этой цели были поставлены и решены следующие задачи:
1. Разработать методологию для эффективного создания и использования сложных модульных моделей биологических систем.
2. Разработать программный комплекс, реализующий весь инструментарий, необходимый для успешного использования предложенной методологии.
3. Продемонстрировать возможности разработанной методологии и программного комплекса для создания и использования сложных моделей биологических систем, включая:
‒ модель клетки (виртуальная клетка) и основных процессов, происходящих в ней (метаболизм, транскрипция, трансляция, гликозилирование, отдельные пути передачи сигнала, апоптоз);
‒ модель физиологии человека и биохимии человека;
‒ модели воздействия лекарственных препаратов на отдельных пациентов (виртуальный пациент).
4. Как часть программного комплекса разработать систему для анализа генетических данных при помощи сценариев.
-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Трансляция семинара будет осуществляться на платформе BigBlueButton по ссылке: https://vcs-3.ict.sc/b/nmm-jge-zjd